国家体育馆的水源热泵技术也是充分利用了可再生能源。工程设有5台HD660B型水源热泵机组。机组主要为夏季观众区赛时空调散热。冬季大型比赛、机会时内区供暖。平时冬季采暖(兼做值班采暖)并为生活热水提供热源。满足夏季奥运赛时空调热负荷及赛后馆内各种活动的需要、国家体育馆充分利用自然通风和采光,并用可开启式外窗排风,外门补风加强了空气流动,让运动员和观众都能可以享受舒适的赛事环境。
此外,国家体育馆的集散广场铺装采用渗水地面材料,使大部分雨水能渗透到地下,屋面上的雨水也可以进行收集,经处理后可用于冲厕、浇灌绿化、冲洗道路等。